从指纹“接触DNA”中获取DNA图谱
11/13/2014
Amy R. Volpert
有一种新方法提高了从指印/指纹中获取DNA图谱的成功率。这将给法医鉴定带来怎样的改进?
指印(指纹)和DNA是现代法医鉴定的两大核心,每种方法在犯罪调查中用于识别特定的人都有着极其重要的作用。除了指纹识别中典型的脊状和螺旋状外,指印中经常包括个体遗留的“接触DNA”。DNA检验具有更高的识别特异性,在只有部分指纹或指纹污染的情况下会更有用处。
图1 利用NGM 筛选试剂盒得到的STR DNA图谱
可惜的是,通常指印中分离得到的DNA总量非常小,这就导致了当试图利用现代技术获取DNA图谱时成功率很低(5%-6%)。
现在,BioTechniques 11月刊登的一片文章中,澳大利亚弗林德斯大学Jennifer Templeton 和 Adrian Linacre描述了一种新方法,能使从指纹中获取DNA图谱的成功率大幅度提高。该方法利用的是已商品化生产的短串联重复序列(short tandem repeat ,STR)分型试剂盒。Linacre说:“我们已经显著提高了原有项目的成功率,并且第一次没有经过强效扩增的方法就从指印中得到DNA图谱。
为了从指纹中收集带负电荷的DNA,作者使用经过Triton-X润湿的带正电荷的尼龙纤维做成的拭子。Triton-X是一种去污剂,能够溶解膜脂、蛋白质以及其他能够隔绝DNA进入PCR试剂的细胞成分。抽汲指纹后,将拭子纤维直接放置于PCR管中,避免了通常DNA提取过程中样品损失的可能,减少了分析的时间和成本。
Linacre提到:“PCR开始时95℃加热步骤和Triton-X的添加已经降解了角质细胞和角蛋白的核膜并释放DNA到溶液中。我们相信这样可以最大限度的保证游离DNA和细胞用于扩增反应。”
Templeton 和 Linacre用这种方法从指纹中分离DNA成功率达到66%–74%,达到了等位基因检测的最小数量,符合澳大利亚DNA数据库的上传标准。这对标准的实验方法是一个重大改进。
作者进一步检验了手洗和指纹产生的间隔是否影响DNA在指纹上的沉积和DNA图谱的获取。由于在手洗后立即采集样本(用温水不用肥皂),没有检测到等位基因;然而,15分钟过后,DNA图谱在大多数指纹中产生。虽然洗手后指纹沉积1-2个小时,非预期等位基因的几率更高(例如,污染),但也得到了相似的结果。
然而,指纹中分离出的DNA总量不能严格依照个人最后洗手的时间,Linacre说,“个体在手洗后经过更长时间,不一定会沉积更多的DNA;这可能要知道个体在这个时间段参加了哪些活动,这些活动将最终影响形成图谱的结果”。另外,根据人们是否能在他们的指纹上沉积足够的DNA进行成功的分析,将个体分为两类“发生体”和“非发生体”。
“由于标准PCR条件的应用,这个方法有机会进入到法医实验室” Linacre说道,值得注意的是直接PCR方法消除了额外增加PCR循环的需要,并且这个研究中获取的指纹DNA图谱显并没有显示低模板DNA分型问题。“我们正在简化过程使这个技术更简单,更适用于法医领域检测” Linacre又说道。
但在那之前,如果你正在计划任何犯罪事件,那就经常洗手并祈祷你是一个非发生体吧。