阅微基因丨植物 SSR panel检测服务开通啦!
一、SSR是什么?
简单重复序列(Simple Sequence Repeat,SSR,也叫微卫星DNA(MS)或短串联重复序列(STR)是一类广泛存在于真核生物基因组中的DNA串联重复序列,其核心序列一般为2-6bp,重复次数多数为5-30次。 多数STR基因座具有多态性,主要源于核心序列重复次数的个体差异,这种差异在基因传递的过程中一般遵循孟德尔共显性遗传规律。如下展示为一个简单的 4 核心序列(AATG) 在不同个体内分别为 7、8次重复的情况:
二、植物SSR 检测应用场景
在植物中,SSR 标记具有非常高的多态性,主要应用于遗传多样性分析、遗传图谱构建、种子纯度鉴定、种子品种鉴定等,下面分别介绍展示下各类应用情况:遗传多样性分析:SSR标记技术被广泛用于评估植物种群内的遗传多样性。通过比较不同个体间的SSR位点差异,可以了解种群的遗传结构多样性和亲缘关系。
构建遗传连锁图谱:SSR标记技术也用于构建基因组的遗传连锁图谱,这有助于研究基因与性状之间的关联关系,并定位关键基因位点。
品种鉴定和种质纯度分析:SSR标记技术还可用于植物品种的鉴定和种质纯度的分析。通过检测种子中的SSR位点,可以确保种子的质量和遗传纯正性。
三、阅微农业植物SSR检测经验丰富
在种质资源日益受重视的今日,阅微基因受国内农林/种质资源领头单位委托,合作进行作物品种国标分子检测、兰花、枸杞等地方特产植物的基因身份证及遗传距离分析项目。目前阅微农业SSR项目的年检测样本数已上万例。如下展示了部分合作进行 SSR的物种情况:
四、阅微重要农作物 SSR panel检测服务
自 2014 年农业部联合各地重点农作物农科院、研究所、农林科学院等单位起草几个主要粮食作物的品种鉴定SSR 检测行业标准,根据该标准,阅微基因开发了检测作物SSR 的 panel。该 panel 采用荧光 PCR 扩增(Quantitive Fluorescent PCR,QF-PCR)结合毛细管电泳检测的方法,进行扩增片段产物大小的准确检测。
检测部分结果展示:
五、阅微基因提供全流程整体解决方案
如您需要落地检测的完整解决方案,阅微基因以多重PCR检测试剂为核心,基因分析仪为载体,整合自动化分析软件,真正完成了从样本采集、试剂检测、报告分析的一站式的整体解决方案。软件开发方面,除了可以定制开发完全知识产权的中文报告软件,还可针对客户需求提供数据库开发服务。
检测流程尤其简单便捷,一名技术人员可以完成多种项目的全部操作,从DNA到获得结果2.5h 即能完成,人工只需 20 分钟。
六、高标准、严要求的试剂盒开发
经过多年的试剂盒研发经验积累,阅微基因已经制定出一套严格的研发流程,多款临床及法医产品获得注册证,经受住了市场的严格考验,质量靠谱。如想自建实验室检测,希望获得高品质的试剂盒开展大量、快速的检测,阅微基因可以根据需求定制化开发试剂盒。